Chi cục Hải quan Thủ Dầu Một tọa lạc tại địa chỉ số 18 L2-1 Trần Quốc Toản, phường Phú Hòa, Thành phố Thủ Dầu Một, tỉnh Bình Dương. Chi cục được thành lập trên cơ sở nâng cấp Đội thủ tục Hải quan Khu liên hợp thuộc Chi cục Hải quan KCN Mỹ Phước.
Từ khi hoạt động năm 2009 đến nay, tình hình hoạt động xuất nhập khẩu tại Đội Thủ Tục Hải Quan Khu Liên Hợp luôn ổn định và phát triển, số thu nộp ngân sách luôn đạt và tăng so với cùng kỳ, kim ngạch XNK tăng trung bình trên 25%/năm, số tờ khai đăng ký hiện nay đạt trên 400 tờ khai/ngày.
Lúc đầu mới thành lập, số thu của Đội Thủ tục Hải quan Khu liên hợp chỉ đạt 2,1 tỷ đồng/năm, số tờ khai đạt hơn 1.900 tờ khai, số lượng doanh nghiệp là 120. Tuy nhiên, đến năm 2010, đội thu đạt hơn 77 tỷ đồng, gấp gần 40 lần so với năm 2009 cùng số tờ khai là hơn 22.000 tờ khai, doanh nghiệp tăng lên 377. Năm 2016, số thu đạt gần 1.000 tỷ đồng cùng với hơn 100.000 tờ khai và số doanh nghiệp là hơn 1.100. Qua đó cho thấy mức độ đô thị hóa, thu hút đầu tư doanh nghiệp FDI về Khu đô thị Bình Dương tăng rất mạnh, đặc biệt là các doanh nghiệp Nhật Bản, Hàn Quốc…
Với số lượng doanh nghiệp đến làm thủ tục hải quan tại Đội thủ tục Hải quan Khu Liên hợp hiện nay khoảng 950 doanh nghiệp, số lượng tờ khai phát sinh hàng ngày khoảng 400 tờ khai/ngày, bình quân một công chức phải kiểm tra đăng ký gần 100 tờ khai/ngày thì với mô hình tổ chức cấp đội là chưa phù hợp, gây quá tải trong công việc, dễ dẫn đến các sai sót về nghiệp vụ do thiếu công tác kiểm tra chéo với nhau.
Xuất phát từ các phân tích tình hình trên, từ định hướng phát triển kinh tế- xã hội của tỉnh, và để tạo thuận lợi cho hoạt động xuất nhập khẩu của các doanh nghiệp trên địa bàn, Bộ trưởng Bộ Tài chính đã ra Quyết định số 2674/QĐ-BTC ngày 16/12/2016 thành lập Chi cục Hải quan Thủ Dầu Một trực thuộc Cục Hải quan Bình Dương.
Phát biểu tại buổi lễ, ông Trần Thanh Liêm, Phó Chủ tịch UBND tỉnh Bình Dương nhấn mạnh, nâng cấp Đội thủ tục hải quan Khu Liên hợp lên Chi cục Hải quan Thủ Dầu Một là rất cần thiết trong tình hình phát triển kinh tế tại địa phương và cũng để tạo điều kiện phát huy hết tiềm năng, thế mạnh của vùng kinh tế trọng điểm phía Nam. Trong đó, có việc tạo điều kiện thuận lợi cho hoạt động xuất nhập khẩu ủa doanh nghiệp đầu tư trong Khu liên hợp Công nghiệp – Dịch vụ – Đô thị Bình Dương được Chính phủ phê duyệt với tổng diện tích qui hoạch là 4.196 ha.
Giao nhiệm vụ cho Chi cục Hải quan Thủ Dầu Một, Phó Tổng cục trưởng Tổng cục Hải quan Hoàng Việt Cường nhấn mạnh, đơn vị cần tích cực phát huy thành tích chung của Cục Hải quan Bình Dương trong công tác cải cách hành chính, xây dựng và triển khai thành công 37 dịch vụ công trực tuyến, tạo thuận lợi tối đa cho doanh nghiệp. Hoàn thành và vượt chỉ tiêu nhiệm vụ thu ngân sách năm 2017, giữ vững vị trí là một trong những đơn vị có số thu nộp ngân sách lớn trong toàn ngành. Làm tốt công tác chống buôn lậu. Xây dựng lực lượng Hải quan trong sạch, vững mạnh, không gây phiền hà, nhũng nhiễu cho doanh nghiệp…